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A imunofenotipagem por citometria de fluxo é uma análise diferencial de células normais e anormais em sangue periférico ou medula óssea com detecção simultânea de marcadores múltiplos em populações de células distintas. É uma ferramenta importante no diagnóstico de malignidades hematológicas. Este exame detecta antígenos citoplasmáticos, nucleares e de superfície, expressos por células leucêmicas, identificando os marcadores celulares expressos em cada tipo de leucemia, indicando o estágio de desenvolvimento do clone leucêmico. Pode ser utilizada na classificação das leucemias indiferenciadas linfóides ou mielóides, na identificação de leucemias bifenotípicas, no monitoramento de terapias, na doença residual mínima, na avaliação de leucocitoses, além de esclarecer pontos importantes para o prognóstico e para a terapia das leucemias agudas. Os marcadores analisados variam de acordo com a hipótese diagnóstica do paciente.